重要的区别是其化学性能：低硼硅西林瓶的内表面耐水我国标准是2.6mm，中性硼硅管制西林瓶内表面耐水我国标准是1.3mm，简单说“耐水”就是小瓶在制瓶厂后续加工过程中吸附在小瓶内壁上钾钠等的有害的碱性氧化物，氧化物越少耐水就越好，耐水好对药的PH，酸碱度，澄明度，稳定性等各种指标就非常好。
    物理性能：中硼小瓶尺寸公差非常小，如16管外径公差标准是正负0.14mm，色泽晶莹剔透，强度非常好，与生产设备很好匹配；低硼硅公差大且批批之间不稳定，如16管外径公差正负标准是0.3mm，颜色偏绿，很难与进口设备或好的设备相匹配。
    国内价格：低硼含硼量在5~8，中硼含硼量在8~12，国内目前只有几家有中性硼硅的注册证，国产的有泊头超成，进口的有德国肖特，同容量中性硼硅西林瓶的价格是低硼的10倍左右，所以国内大部分的厂家还是沿用低硼硅。